Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps8Q0P5W1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms