Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms