Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NeblQ0II04 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms