Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms