Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncf1Q09014 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncf1Q09014 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms