Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4Q08624 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc4Q08624 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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