Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms