Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms