Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms