Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms