Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprgQ05909 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprgQ05909 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms