Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hspg2Q05793 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms