Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a1Q05722 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a1Q05722 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms