Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms