Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn6Q03958 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pfdn6Q03958 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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