Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms