Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms