Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd1Q02242 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms