Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RykQ01887 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms