Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms