Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms