Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelpQ01102 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SelpQ01102 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms