Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2bQ01097 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms