Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms