Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SeleQ00690 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms