Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga4Q00651 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms