Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms