Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PgrQ00175 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PgrQ00175 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms