Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp10Q000W5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms