Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb4P99026 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 334.2 ms