Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bmp1P98063 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms