Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp6P97868 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp6P97868 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms