Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlkP97793 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AlkP97793 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AlkP97793 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AlkP97793 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AlkP97793 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AlkP97793 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlkP97793 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlkP97793 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlkP97793 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms