Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd3P97770 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms