Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms