Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme1P97371 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms