Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp1P97350 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms