Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms