Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfi1P70338 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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