Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx1P70323 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms