Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms