Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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