Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf6P70196 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms