Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl23aP62751 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl23aP62751 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms