Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Smg6P61406 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg6P61406 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smg6P61406 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms