Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snap25P60879 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snap25P60879 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms