Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms