Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Paxbp1P58501 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms