Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Setd4P58467 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Setd4P58467 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms