Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpdl3bP58242 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms